顺则生人逆则成仙的内丹学原理。按照道家与道教的宇宙创生演化及人体生成说，宇宙和人体生命的生成皆源于道。道自虚无状态中化生出元始先天一，又从一中产生阴阳二性。由于阴阳二性的交会、激荡，产生物质、能量、信息三大元素，再由三元演化成万物纷纭的世界。这就是老子《道德经》“道生一，一生二，二生三，三生万物”的宇宙演化图式。人的生成也和宇宙的创生图式相感应，宇宙中的元始先天太乙真气，在父母阴阳两性交合时被招摄进母腹之中，形成胎元，将性命寓于其中。直至十月期满，胎儿长成，出离母腹，“哇”的一声，先天祖气断开，后天气生。以后每32个月。生元气64铢，由复卦、临卦至16岁乾卦，得384铢元气，为纯阳之体。其中父母初交，于恍惚之中，合成一，生长出形体未具，神未判，处于混沌状态的胎儿，为人道的“第一变”，由心肾成形，神始分，到十月胎圆，婴儿降生，为人道的“第二变”。由初生儿至16岁少年，阳精成熟将泄，情欲始萌，为人道的“第三变”。而后识神用事，情欲伤身，每96个月，则生一阴，由24岁卦，经32岁遁卦、否卦(40岁)、观卦(48岁)、剥卦(56岁)、至64岁坤卦，元气耗尽。内丹学修炼功夫是一种人体返还工程，即由坤卦返回乾卦的返老还童之术。内丹学的基本原理是认为宇宙演化和人体生命都可以从逆的方向上进行反演的思考。顺则生人生物，逆则修炼成仙。内丹家以“三关修炼”阻止人体熵效应，通过“炼精化”的初关仙术将精化尽只剩下羔和神.为“三归二”的过程；然后“炼化神”的中关仙术为“二归一”的过程，最后“炼神还虚”地上关仙术返还于虚无之道。这样人体沿着逆的方向由“第三变”返到“第二变”，再从“第二变”返到“第一变”，直到虚无之道，内丹就修成了。

虚无之道和先天一说。内丹学要追求一种长生不死、永恒不灭的状态。而根据自然科学定律凡是产生的东西最终都要灭亡，仅有虚无是不生不灭地。这样，返还虚无之道就成了内丹学追求的目标。《唱道真言》云：“夫道之要.不过一虚，虚含万象。世界有毁。惟虚不毁。道经日形神俱妙.与道合真。道无他，虚而已矣。形神俱妙者，形神俱虚也。”内丹学认为在宇宙未创生之前，是一片虚无。当宇宙创生之时，虚无之道化生出元始先天一，这种先天一被认为是宇宙万物运动的一片生机，也是生命运动的源泉。因之，阴阳双修和清净孤修两派丹法都以招摄先天一为目标。我们推测。先天一大概是宇宙大爆炸之前的初始信息，是时间和空间还没展开的宇宙本源，是自然界最根本的内在节律。初始的宇宙中隐藏着秩序，存在着产生普适地宇宙节律的信息源。内丹家通过一种将人体节律和宇宙节律调谐的技术，使人体精、气、神等元素充分激发，在量子层次上和自然界的本源相互作用，将这种残留在宇宙中的初始信息招摄到体内。内丹家将人体和大自然的内在节律相调谐，使自己的身心与混沌的宇宙融汇为一体。返回先天地初始状态，才能同宇宙的自然本性契合，进入道的境界。

意识的三层次说。根据我们对内丹学地研究，发现人的意识的器官不仅是大脑皮质。还包括丘脑、网状结构，甚至还有心脏等，中国古医家认为心主神明，肝出谋虑，胆主决断，肾出伎巧等是有根据的。/这就是说，思维和情感活动在躯体层次上是以人脑及内脏器官等相互制约的复杂生理系统为基础的。人体的内分泌激素。后天和先天地精、气、神也是一个系统。是可以相互影响，互相转化地。人体生命运动的精、气、神恰好和物理化学运动中地热、力、光三种效应相互对应.它们都是生命运动的存在形式。其中最要害地是神。人的心理也是有结构的，是一种过程的秩序。意识是生命运动的最高形式。它可以凝聚为一种有着超微结构的高度有序的客体。人的心理系统中的意识活动和无意识活动都是人类在进化过程中大自然赋予的重要心理功能，其中无意识活动决非无足轻重的自然现象，而是一种深层意识，是人类改造自然和社会的重要潜能。意识活动的生理机制主要在大脑顺叶，无意识活动的生理机制在大脑的网状结构和丘脑。随着人类进化，人的大脑皮质日益发达，网状结构的范围相对减小，但网状结构中的核体却日益复杂和分化，人的深层意识也愈加显不其重要的调节作用。我们可以断定人的意识共分为三个相互联系的层次，即常意识旧常的认知、思维活动，、潜意识和元意识。///常意识是心理表层的理性思维活动，内丹学家称之为“一识神”，它包括人们的感知、判断、推理等一系列心理程序。内丹功夫中识神的活动分为正念和邪念，内丹家要排除邪念，凝聚正念，集中人的意念力透入深层意识之中，增强常意识的可控度，使之以意念力的形式得到凝炼和升迁片潜意识是一种非理性的意识层次，包括人们平常不易觉察的童年记忆和隐藏的各种人生欲望、性欲、心理创伤等印痕。日常生活中的重大刺激往往会透过表层常意识在潜意识中留下痕迹。这些潜意识的印痕反过来又在背后强有力地影响着人们表层的心理程序，人们可以从梦境、幻觉、灵感、直觉、精神病等心理状态中破译出潜意识的原形，内丹功夫中出现的不良心境、恶劣情绪、各种魔境、幻觉等都是潜意识作怪内丹功法要净化潜意识，自我清洗自胎儿期以来键入的各种印痕，并通过一定方式将炼丹的程序编码输入潜意一识之中。这种潜意识中的炼丹程序编码就是“真意”，它被称作勾引精、气、神等生命要素相互化合作用的“黄婆”。潜意识可以在内丹修炼中逐步人格化，凝炼为“阴神”。阴神是人格化了地潜意识，可以如梦中之身般的脱体而出，具有遥感、透视、预知等超常的人体潜能。人类心理的最深层次是“元意识”。在内丹学中称作“元神”。内丹修炼到元意识显现时，呈一种极端清醒却毫无思维地心理状态，这说明元意识是比潜意识更深一个层次的意识，相当于佛教唯识学指的阿赖耶识。丹家亦称为宇宙和人体发生之初的“一点灵明”，是一种遗传的本能意识。元意识是人类在漫长的生物进化中遗传在头脑中的尚未开发的信息库，它包藏着生物进化史上曾经有过地智慧和能力，是人身真止的“自我”，因之丹家称为“主人公”元意识在人体工程中通过开发和凝炼，可以逐步人格化为“阳神”。几乎所有的炼丹家都以其亲身经历表明阳神是元神的凝聚体，有成熟的人格，是有形有相的自我。可以脱体存在，具有突破时空障碍的巨大神通。丹家将人的躯体称作“色身”，将阳神称作“法身”，也叫身外之身，出阳神是内丹人体工程地重大目标，也是内丹学研究中最棘手的一项课题。实际上，内丹学是一项凝炼常意识、净化潜意识、开发元意识的系统工程。它只有在自然科学能够充分地解释人的大脑神经地奥秘时，才可能在实证的层面上获得突破性进展。

取坎填离术。内丹学认为后天的坎、离二卦是由先天的乾、坤二卦中间的阴、阳两爻互换位置造成的。《渔庄录》云：“先天八卦，乾南坤北。因男女交媾之后，乾体破而为离，坤体实而为坎。故后天八卦。谓离南坎北，盖以离代乾，坎代坤也。”内丹学要从后天返回先天，变离为乾，变坎为坤.因之丹功修炼要求将坎卦中的阳爻再抽回来，填入离卦中阴爻地位置上，使之回复到先天乾卦地纯阳之体。内丹家称之为“取坎填离”。离、坎二卦在阴阳双修丹法中是男女的代号。意思是以男子离器中地真阴摄取女子坎户中的真阳，从而阴阳交媾而成丹。清净孤修丹法。又以离、坎二卦为心、肾地代号，或以离喻心神。坎喻元、真精。这样，取坎填离术在小周天中指心液下降、肾上升，又称还精补脑；在大周天中指消阴炼阳、定神纯，又称抽铅添汞，《悟真篇》讲“取将坎位中心实，点化离宫腹内阴。从此变成乾健体，变化飞跃总山心”，将取坎填离术看作内丹学的基本功夫。丹家称“取坎填离”、“抽铅添汞”、“还精补脑”、“心肾相交”等，用现代的语言说，实际上就是从自我调节人的性激素及内分泌入手，通过增强人的性功能来恢复大脑的青春活力。再确切点说，就是从调整人的内分泌入手改善整个神经系统的状况，协调人体性腺和丘脑的负反馈机制，由生理的和谐推进心理和谐及人体潜能的开发。道教医学本来就有补肾可以健脑的思想，内丹学则更突出了肾和脑、包括神经系统及心理层次的联系。内丹学初关仙术以精为基础，气为动力，神为主宰。人在高度入静的状态中，性腺、松果体、脑下垂体的内分泌相互激发，从而使全身在生理和心理上都达到一个和谐有序的新水平。这就是取坎填离的效果。

《参同契》云：“三五与一，天地至精。可以口诀，难以书传。”《悟真篇》云：“三五一都三个字，古今明者实然稀。”方壶外史•悟真篇小序》云：“三五与一，天地至精；龙从火出，虎向水生；二物欢会，俱归中宫；三家相见.怀胎结婴。”这些话被称为丹家之秘。实际上，水金和木汞通过真意化合成丹，也是取坎填离的意思。心肝脾肺肾五气朝元，精神三华聚顶，都不外是摄取先天一与元神凝炼成丹而已。