时任圣战军总司令乃是达利帝国破日军团军团长海顿侯爵，海顿侯爵虽然是杨平一手调教出来的军事奇才，但一边受制于达利帝国内部，一边受制于和平仲裁委会员，根本没有办法一展军事才能，再加上他又没有办法平衡各国贵族、军队的利益，这个总司令一直作得很不顺利。在魔族的全面进攻开始不久，人类军便出现多次失误，甚至开始溃败。东部战区若不是大秦帝国大三军团苦苦支撑着，魔族已经长驱直入，打到了迷惘森林以西。
其后不久，因为政治原因，海顿侯爵被解职，新任圣战军总司令又换成了费米罗帝国某位元帅，但仍然无法阻止人类联军的溃败。眼见圣战军已经不可倚仗，大秦帝国再次起用在陆基堡军事大学学习的陆正刚，并正式任命时年28岁的陆正刚为大秦帝国三军统帅，晋衔五星上将。
赶到东部战线之后，陆正刚重振大秦军队以及人类联军残部，开始了防守反击。至此，形势才略为好转，但是，东部战区的第一道防线已经被完全攻破，陆正刚不得不组织军队退守第二道防线，并伺机夺回第一道防线——虽然他也知道这有些不可能。
这些年来，安比斯带领他的炼金学院制造出了许许多多威力奇大的魔法武器，并正式装备军队使用。再加上格林带领的诺德骑士、希丁克带领的魔法军团前来助战，仅凭着大秦一国之力，艰难地和魔族对抗着。若不是有着新出来的魔法飞行器、钢铁战舰等空海武器出现，大秦帝国哪里能和上千万的魔族对抗了？
眼见争权夺利已经在圣战军、和平仲裁委员会里出现，感觉到不好苗头的教皇、杜勒姆、龙九三人再次于海拉第安聚首，并对一批争权份子进行了血腥的清洗。其后，经过三人会商，终于任命年龄不足30岁的大秦帝国东部战区总指挥为圣战军总司令，主持人类联军对抗魔族事宜。在陆正刚全部接手圣战军军权后，毫不留情地清洗了一批前来捞取军功的贵族后，圣战军战力大有提升。在5107年夏，在第二道防线被攻破情况下，陆正刚带领全军反击，不但将差点打到陆基堡的魔族军队给赶回迷惘森林以东，收复了第二道防线，甚至还差点收复了第一道防线。面对又一场空前的胜利，人类又开始了新一轮的争权……
而在这一轮争权里，大秦帝国也被卷入其中。皇室想修改宪法，重获至高无上的权力，督政院的贵族们更可怕，他们甚至想分裂庞大的大秦帝国，自立为王。眼见强敌虎视，而国内乱成了一团糟，不得矣之下，陆正刚只得请求秩宗陛下出面主持国政，希望在魔族被打退之前，军队可以有个安定的后方。
然而，无处不在的黑暗终于开始全面侵入亚宁大陆各处。在大秦帝国的国内矛盾正成为各国的焦点时，佛朗士帝国与费米罗帝国再次爆发战争，其后不久，特伦帝国也加入到这场大混战里来。本来就是世仇的达利帝国、萨卡维拉帝国再次开战……和平仲裁委员会经过多方努力，却没有办法控制泛大陆的战事，愤然之下，教廷、明达斯威克以及杨家都出动强大的武装力量进行干预。本以为可以暂时控制住战争局面，哪知道却激起了大陆各国的强烈反弹。
5108年秋，罗恩帝国与蛮族草原联合起来，声称坚决支持和平仲裁委员会的决议，并发兵对掀起战争的佛朗士帝国、费米罗帝国进行惩戒——后世史志记载的第三次黑暗战争、也就是第一次大陆战争全面爆发开来。
其后不久，大秦帝国西都战区、西宁战区也出现了叛乱，并越演越烈。督政院、皇室正面临着争权夺利，无力西顾，只得变向承认了西都战区、西宁战区数十个大小王国、公国的独立。秩宗陛下出面之后，仍然无法调解国内的矛盾，不得矣之下，秩宗陛下只得宣布罢黜皇帝、督政院，国家大政暂时他主持，诸英主持国务院政务。在无力控制大陆局势的情况之下，和平仲裁委员会只得宣布暂时休会，龙九带领杨家的武装力量进入大秦帝国，开始干涉大秦帝国内部事务。
时至5012年，杜拉尔山脉以西的战争依然如火如荼地进行着，随着费米罗帝国的崩溃，因为蛮族士兵在费米罗帝国境内展开的一场大屠杀，战争的矛头又开始突然转向了外族入侵……
与哈尔比大陆有些近似，先是混乱，接着就是纯粹的为了杀戮而杀戮！
光明教廷的影响力急剧减弱，为了保住教区及信徒，教廷也不得不调用光明军团参与进了大陆战争中。在悄无声息当中，精灵森林派出了10万精灵赶赴九州，坚定地支持起抵抗魔族的战争。
经过12年的战争，大秦帝国的国力已经见底，只凭着两千年来养成的坚毅个性在坚持着。有了10万精灵的加入，无疑可以让他们暂时喘口气，可依然无法抵挡住在稳步向西推进的魔族军队。
5012年6月1日，第二次神魔战争爆发12周年纪念日，大秦帝国再次丢失第二道防线，无奈地退守陆基堡，悲凉地准备着最后的防御。
因为受到魔族的威胁，九龙城、铁血堡、森罗城都相继迁入陆基堡，没有停息的争权反而导至陆基堡也开始混乱不堪。眼见形势再得不到稳定，连陆基堡可能都要丢了，大秦亡国之日也就不远了，忧心如焚的陆正刚思量着是否开始实行军管，但是，如果他开了这样的先例，后果无疑是非常严重的，但如果不实行军管，如何控制这些时刻压在他头上的权贵们？如何统一起大秦的军事力量进行有效的防御？
他不是杨平，没有那通天的实力与威望，就算得到了秩宗陛下的授权又怎么样？军管的希望依然邈茫！想到这样的结果，35岁的陆正刚没由来的一阵悲哀，难道大秦真的要在第二次神魔大战中彻底地崩溃，华族要在这一次的九州战争中彻底的灭绝么？