故事主要述说刘基於元朝末年之时所发生的虚构故事。 刘基本是一名为政清廉的好官，在处理一场元人与汉人之间的冤案时，因为得罪了高官皇族，被下令通缉，临死之前所幸遇上身负天命的蜀山派「寻龙使」，侥幸逃过了一劫。 刘基成了寻龙使的传人之後，准备寻找适合担任皇帝之人，这时候他遇上了一名和尚。 此後因缘际会之下，刘基得以加入白莲教，并且靠着高强的武艺与谋略，取得了致高的地位，不料白莲教主韩山童与彭莹玉两人因私慾暗中合作，刘基被害，抗元大计功亏一篑。 就在刘基退隐之时，陈友谅默默做大，与张士诚成了两股巨大的势力。刘基退隐数年，又遭徐达与常遇春打扰，怎知道徐达与常遇春便是昔日朱重八的结拜兄弟。 经过了一番简易试验，刘基决定帮助朱元璋。此时陈友谅正与朱元璋作战，刘基以《火龙神器阵法》助朱元璋取得龙湾之战的胜利，亦遭朱元璋的仁慈之心感化，决定扶没有龙气的朱元璋为帝。