第二兵团也对曾国峑的主力进行了有限追击，消灭了一部分殿后掩护的敌军。曾国峑率部退往江西、浙江交界一带。殿后的一部分湘军在我军停止追击作战的情况下户那个不择路逃向浙江左宗棠防区，左宗棠的做法几乎和李鸿章一模一样：让和法国人合办的常捷军洋枪队把他们缴械后再接收。

占领南京的我军倒也不急于向周边扩大占领区。只是舰队继续向西前进。安庆、芜湖水面的湘军水师残余被一扫而空。舰队并没有运载大量步兵登陆围攻安庆，只是略略炮击之后，继续西进。西进的舰只除了6条从英国进口的大船，其余的返回了南京，那些快艇消失在了附近的支流港汊。甚至部分返回了淮河。好像根本没有参战过一样。消灭湘军水师都是从英国进口的舰只的功劳，或者那条在进口英国设备和技师的天津船厂制造的邙山好也发挥了一些作用。现在邙山号停在正南京北面的江面威风凛凛地守卫着下关一带水上门户。旁边的几艘“河”级炮艇和它比起来简直不值一提。犹如众星捧月。

两天后，6条进口军舰到达了武汉江面，残余湘军水师在他们到来前急忙向西撤退，希望在他们到来前撤入洞庭湖。

在此之前的几天，驻守汉阳的我军连续几天零星炮击武昌。罗泽南心中吃惊：“假洋们居然有能打这样远的大炮！？还好不多，要不然这武昌可就危险了。大约洋人自己这样的大炮也不多，哼，不是英夷就是法夷，听说那边现在有冒出个普夷，造大炮的本事好的很，说不定是他们与徐陈假洋勾结也说不定。”思维方式倒是真的和汉口租界里的洋人不谋而合。下游水师战败的消息传来。罗泽南就做了撤退的打算。

6艘英国进口的对于湘军水师而言的“巨舰”出现在水天之处的时候，武昌的湘军难以名状的恐慌。罗泽南马上下达了撤退令。虽然已经做了准备，可是恐慌中的撤退还是演变成了溃逃。

随舰队而来的不到1千人的陆战队在汉阳门码头登陆，进占武昌。这是海军第一次单独占领城市，还是这样重要的省城。

第二兵团开始大举渡江。一切可以找到的渡船都用上了。舰队中的几条护卫舰也充当起了“渡轮”。

赖文光第一批过江，踏上武昌之地，心中感慨万千，回忆起往事种种，不仅潸然泪下。不过他迅速控制住自己的情绪。先期过江的一个团已经整理出了建制，赖文光当即带领该团向南追击下去。追击溃退的敌军是收益最大的战斗行动。赖文光对此理解很深刻。他把随同他过江进入武昌的军部人员留在码头，嘱咐，过来一个团就立刻投入一团参加追击。直到接到停止追击的命令，否则最远可以允许追击到湖南或者江西的边界再停止。

赖文光的这一招果然奏效，在接下来的三天里，罗泽南损失了全部的辎重，到了湖南境内的时候，兵力已经不足撤退开始时的10分之一。赖文光追得太快，而湘军撤退的秩序又乱。被冲得七零八落，很多人被俘。幸亏赖文光旧部大半被姚大喜带往陕南了，不然这些湘军投降他们可是有可能性命不保的。虽然现在他们名义上是被朝廷的军队俘虏的。如果i追来的是太平军，说什么湘勇们也不会有这么多人被俘的。